Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCBQ16585 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms