Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NEDD8Q15843 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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