Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
HERC1Q15751 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HERC1Q15751 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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