Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIP10Q15642 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP10Q15642 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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