Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUM3Q15397 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUM3Q15397 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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