Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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BRD3Q15059 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRD3Q15059 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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