Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LAPTM4AQ15012 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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