Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SHROOM2Q13796 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
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SHROOM2Q13796 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
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SHROOM2Q13796 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
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