Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTMR3Q13615 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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