Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMAD4Q13485 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD4Q13485 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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