Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKRN3Q13064 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKRN3Q13064 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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