Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC16Q13042 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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