Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXD4Q12950 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms