Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXC1Q12948 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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