Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX10Q12887 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX10Q12887 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX10Q12887 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX10Q12887 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX10Q12887 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX10Q12887 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms