Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 SCP160YJL080C 3669 nt2.29□□□□□ -2.04
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HAL9Q12180 SPC98YNL126W 2541 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 CLN3YAL040C 1743 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 SGF11YPL047W 300 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 MSB1YOR188W 3414 nt2.29□□□□□ -2.04
HAL9Q12180 snR74snR74 88 nt2.28□□□□□ -2.04
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HAL9Q12180 IST2YBR086C 2841 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 SAS3YBL052C 2496 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 NOP14YDL148C 2433 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 REV3YPL167C 4515 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 UBR1YGR184C 5853 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RTT101YJL047C 2529 nt2.27□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 MAK10YEL053C 2202 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 TRL1YJL087C 2484 nt2.26□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 ELG1YOR144C 2376 nt2.26□□□□□ -2.05
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HAL9Q12180 ZIP2YGL249W 2115 nt2.25□□□□□ -2.05
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HAL9Q12180 RPL34BYIL052C 366 nt2.24□□□□□ -2.05
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HAL9Q12180 RLM1YPL089C 2031 nt2.24□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 TOF1YNL273W 3717 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 BRP1YGL007W 378 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YGL217CYGL217C 342 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 APL5YPL195W 2799 nt2.23□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 RAD34YDR314C 2079 nt2.22□□□□□ -2.05
HAL9Q12180 ECM12YHR021W-A 456 nt2.22□□□□□ -2.05
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HAL9Q12180 ULI1YFR026C 510 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 RPS25BYLR333C 327 nt2.21□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.21□□□□□ -2.06
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HAL9Q12180 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.2□□□□□ -2.06
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HAL9Q12180 APL2YKL135C 2181 nt2.19□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 VPS13YLL040C 9435 nt2.18□□□□□ -2.06
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HAL9Q12180 HMI1YOL095C 2121 nt2.17□□□□□ -2.06
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HAL9Q12180 snR52snR52 92 nt2.17□□□□□ -2.06
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HAL9Q12180 CAT2YML042W 2013 nt2.17□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 CTR9YOL145C 3234 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 MSH5YDL154W 2706 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 UBP1YDL122W 2430 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 RPL37BYDR500C 267 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 BUD2YKL092C 3315 nt2.16□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 YLL007CYLL007C 1998 nt2.16□□□□□ -2.06
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HAL9Q12180 PTP2YOR208W 2253 nt2.15□□□□□ -2.06
HAL9Q12180 BNI1YNL271C 5862 nt2.15□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 ATG11YPR049C 3537 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 IRE1YHR079C 3348 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 HER1YOR227W 3741 nt2.14□□□□□ -2.07
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HAL9Q12180 CUL3YGR003W 2235 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 TFC3YAL001C 3483 nt2.14□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 DGR2YKL121W 2559 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 STH1YIL126W 4080 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 LRE1YCL051W 1752 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 SAP190YKR028W 3102 nt2.13□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.12□□□□□ -2.07
HAL9Q12180 RPL31AYDL075W 342 nt2.12□□□□□ -2.07
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