Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 IRA1YBR140C 9279 nt1.6□□□□□ -2.15
FMP40Q08968 KIP1YBL063W 3336 nt1.6□□□□□ -2.15
FMP40Q08968 NPC2YDL046W 522 nt1.59□□□□□ -2.15
FMP40Q08968 EMC5YIL027C 426 nt1.59□□□□□ -2.15
FMP40Q08968 YJL022WYJL022W 309 nt1.59□□□□□ -2.15
FMP40Q08968 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.59□□□□□ -2.15
FMP40Q08968 NHP2YDL208W 471 nt1.58□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.58□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 ZIP2YGL249W 2115 nt1.58□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.58□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.57□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 snR36snR36 182 nt1.57□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 BRR2YER172C 6492 nt1.57□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 NIP100YPL174C 2607 nt1.57□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 CTF4YPR135W 2784 nt1.57□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YDR413CYDR413C 576 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YJR011CYJR011C 786 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 COF1YLL050C 432 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 SPO24YPR036W-A 204 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 ALK1YGL021W 2283 nt1.56□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 KAP122YGL016W 3246 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 SPC110YDR356W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 TRM3YDL112W 4311 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YDR048CYDR048C 315 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YER097WYER097W 330 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 CHS1YNL192W 3396 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 NUT1YGL151W 3399 nt1.55□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 SXM1YDR395W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 UFD2YDL190C 2886 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YFL032WYFL032W 321 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 SDH2YLL041C 801 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 YAR029WYAR029W 225 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 SAC3YDR159W 3906 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 MAD1YGL086W 2250 nt1.54□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 RAD50YNL250W 3939 nt1.53□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 POL5YEL055C 3069 nt1.53□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 VPS55YJR044C 423 nt1.53□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 NOC3YLR002C 1992 nt1.53□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 PIK1YNL267W 3201 nt1.53□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 SSK2YNR031C 4740 nt1.53□□□□□ -2.16
FMP40Q08968 RAD34YDR314C 2079 nt1.52□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 SMC4YLR086W 4257 nt1.52□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 ADR1YDR216W 3972 nt1.52□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 SPC98YNL126W 2541 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YFL063WYFL063W 456 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YGL217CYGL217C 342 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YLR140WYLR140W 327 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 NCA2YPR155C 1851 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 FIG2YCR089W 4830 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 BST1YFL025C 3090 nt1.51□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 SEC5YDR166C 2916 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 NUP192YJL039C 5052 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 SLX4YLR135W 2247 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 MAM33YIL070C 801 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YNL146WYNL146W 303 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YOR376WYOR376W 369 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YSY6YBR162W-A 198 nt1.5□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 SCW11YGL028C 1629 nt1.49□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YCS4YLR272C 3531 nt1.49□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 HTL1YCR020W-B 237 nt1.49□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.49□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YBR174CYBR174C 315 nt1.49□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 TRM732YMR259C 4263 nt1.49□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 VPS54YDR027C 2670 nt1.48□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 PMD1YER132C 5262 nt1.48□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 RPL39YJL189W 156 nt1.48□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 CAT8YMR280C 4302 nt1.48□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 OST1YJL002C 1431 nt1.48□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 STE5YDR103W 2754 nt1.47□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 HKR1YDR420W 5409 nt1.47□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 MPT5YGL178W 2580 nt1.47□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YIL102CYIL102C 306 nt1.47□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 COA6YMR244C-A 315 nt1.47□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 YPR063CYPR063C 423 nt1.47□□□□□ -2.17
FMP40Q08968 DBP6YNR038W 1890 nt1.46□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 snR14snR14 160 nt1.46□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 CCH1YGR217W 6120 nt1.46□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 SLI15YBR156C 2097 nt1.46□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.45□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 COG4YPR105C 2586 nt1.44□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YDL211CYDL211C 1119 nt1.44□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YIR044CYIR044C 186 nt1.44□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.44□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YCK3YER123W 1575 nt1.43□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 LCD1YDR499W 2244 nt1.43□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YGL149WYGL149W 306 nt1.43□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 RPL34BYIL052C 366 nt1.43□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 ALY2YJL084C 3141 nt1.43□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 SEC21YNL287W 2808 nt1.43□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 MDS3YGL197W 4464 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YLL054CYLL054C 2532 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YDR344CYDR344C 444 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 ANS1YHR126C 480 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 YLR422WYLR422W 5799 nt1.42□□□□□ -2.18
FMP40Q08968 FYV8YGR196C 2454 nt1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms