Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSME1Q06323 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSME1Q06323 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms