Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3AQ05086 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms