Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DSG1Q02413 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DSG1Q02413 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms