Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNAQ00169 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms