Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRB1P82279 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRB1P82279 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRB1P82279 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRB1P82279 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRB1P82279 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRB1P82279 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRB1P82279 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRB1P82279 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRB1P82279 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRB1P82279 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRB1P82279 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms