Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVK-24P63145 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERVK-24P63145 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms