Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTBP60709 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTBP60709 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTBP60709 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms