Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVPABLB-1P60509 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms