Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP107P57740 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP107P57740 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUP107P57740 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUP107P57740 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUP107P57740 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms