Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATN1P54259 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATN1P54259 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATN1P54259 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATN1P54259 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATN1P54259 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms