Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DAP3P51398 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DAP3P51398 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms