Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN1P49768 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN1P49768 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN1P49768 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSEN1P49768 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms