Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDC34P49427 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDC34P49427 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDC34P49427 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC34P49427 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC34P49427 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC34P49427 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC34P49427 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDC34P49427 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms