Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTBP49356 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTBP49356 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTBP49356 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTBP49356 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTBP49356 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTBP49356 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTBP49356 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms