Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FNTAP49354 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FNTAP49354 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FNTAP49354 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FNTAP49354 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FNTAP49354 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FNTAP49354 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FNTAP49354 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms