Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCLCP48506 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCLCP48506 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLCP48506 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCLCP48506 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms