Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTTP42858 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTTP42858 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTTP42858 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTTP42858 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTTP42858 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTTP42858 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTTP42858 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTTP42858 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTTP42858 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTTP42858 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTTP42858 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTTP42858 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms