Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIK3CAP42336 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIK3CAP42336 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms