Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHI3L1P36222 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms