Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDE6BP35913 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6BP35913 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6BP35913 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDE6BP35913 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms