Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms