Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGS2P35354 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS2P35354 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms