Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFC4P35249 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFC4P35249 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFC4P35249 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFC4P35249 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFC4P35249 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFC4P35249 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC4P35249 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC4P35249 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC4P35249 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC4P35249 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFC4P35249 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFC4P35249 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms