Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC12P31275 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC12P31275 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms