Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TM4SF1P30408 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF1P30408 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms