Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5AP29375 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5AP29375 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms