Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA3P25788 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms