Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRDP23468 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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