Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRBP23467 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRBP23467 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms