Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GCSHP23434 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GCSHP23434 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms