Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PVALBP20472 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PVALBP20472 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PVALBP20472 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PVALBP20472 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PVALBP20472 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PVALBP20472 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms