Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD44P16070 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD44P16070 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD44P16070 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD44P16070 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD44P16070 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD44P16070 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD44P16070 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms