Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FCER1AP12319 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FCER1AP12319 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms